Saat ini 70% staf pengajar Fakultas Ekonomi memiliki latar belakang pendidikan S2 dan atau S3 dari berbagai universitas terkemuka dalam dan luar negeri. Kualitas SDM yang relatif tinggi tersebut terus ditingkatkan melalui pengiriman dosen melanjutkan pendidikan ke jenjang yang lebih tinggi maupun mengikuti berbagai kegiatan ilmiah (seminar, lokakarya, dan pelatihan) di dalam dan luar negeri. Di samping berdasarkan jenjang pendidikan, tingginya kualitas SDM di Fakultas Ekonomi dapat dilihat dengan banyaknya staf pengajar Fakultas Ekonomi yang dijadikan nara sumber dalam berbagai kegiatan yang berskala regional maupun nasional bahkan pada level internasional.

Kualitas SDM yang tinggi ini tentu berdampak pada tingginya kualitas kegiatan akademik yang diselenggarakan oleh Fakultas Ekonomi Universitas Negeri Jakarta yang akan menunjang peningkatan kualitas lulusan. Di samping itu, kreativitas dan komitmen SDM diharapkan dapat mendukung komitmen pimpinan jurusan dan program studi dalam melahirkan program kegiatan yang memberikan manfaat bagi Fakultas Ekonomi Universitas Negeri Jakarta.

Fakultas Ekonomi yang semula merupakan Jurusan Ekonomi berhasil memperoleh Hibah Due-like sejak tahun 2001 untuk membiayai peningkatan kualitas layanan akademik selama lima tahun di Program Studi Pendidikan Administrasi Perkantoran, Pendidikan Akuntansi, Pendidikan Tata Niaga, dan Pendidikan Ekonomi Koperasi.

Dalam upaya meningkatan kualitas lulusan, Fakultas Ekonomi mendirikan Career Development Center (CDC). Unit ini memiliki fungsi dan peran membekali softskills mahasiswa melalui berbagai pelatihan dan workshop sehingga mereka siap memasuki dunia kerja. CDC juga bertanggungjawab untuk menjalin kemitraan strategis dengan dunia industri dan sekolah sebagai tempat untuk memperkaya pengamalan praktik mahasiswa. Untuk mendukung upaya CDC, Fakultas Ekonomi mewajibkan seluruh mahasiswa mulai angkatan 2006/07 memiliki skor TOEFL minimal 450 dan selanjutkan akan ditingkatkan pada masa mendatang. Fakultas Ekonomi telah menetapkan Program Studi Akuntansi S1 dan Program Studi Manajemen S1 membuka layanan kelas billingual.

Fakultas Ekonomi UNJ memiliki lembaga penjaminan mutu yang setiap saat melakukan monitoring dan evaluasi terhadap kinerja program studi. Lembaga ini berupaya secara optimal untuk menjaga komitmen program studi dalam mengembangkan dan meningkatkan sistem akademik dan administrasi program studi.

Pengelolaan mutu secara internal dan eksternal sudah melembaga dan menjadi komitmen manajemen Fakultas Ekonomi UNJ. Fakultas memelihara relevansi lulusan agar sesuai dengan kebutuhan dunia usaha dan  melalui kajian kurikulum secara berkala. Kajian kurikulum yang dilakukan lebih ditekankan kepada content untuk menyesuaian dengan kebutuhan dan perkembangan yang telah dan akan terjadi pada dunia usaha dan pendidikan. Monitoring dan mekanisme feed back bagi mahasiswa dilakukan dengan cara,  pada akhir perkuliahan mahasiswa mengisi angket tentang penyelenggaraan proses pembelajaran yang berlangsung pada semester tersebut. Hasil ini dipakai untuk perbaikan diri, baik yang menyangkut aspek akademik mapun non akademik.

Fakultas Ekonomi UNJ berusaha mengembangkan sumber daya dengan cara mengirimkan para dosen untuk mengikuti studi lanjut bergelar dan studi lanjut non-gelar,  menyelenggarakan seminar atau lokakarya untuk para dosen dan mahasiswa atau studi banding ke universitas atau lembaga lain, mengundang pakar untuk alih kepakaran, meningkatkan motivasi dosen dalam meneliti dan berbagai usaha lainnya yang dapat merangsang dan meningkatkan motivasi dosen untuk terus belajar sepanjang hayat dalam upaya pengembangan institusi.

Proses evaluasi eksternal secara formal telah dilaksanakan dengan dilakukannya proses akreditasi. Seluruh program studi yang terdapat di Fakultas Ekonomi telah diakreditasi. Hasil dari evaluasi baik internal maupun eksternal akan digunakan untuk perbaikan maupun pengembangan fakultas. Dengan demikian diharapkan mutu lulusan dan mutu penyelenggaraan institusi secara keseluruhan akan terus di kembangkan dan ditingkatkan